个人简历
徐凌洋
徐凌洋，男，汉族，1984年11月生，安徽省寿县人，中共党员，博士研究生学历，研究员，博、硕导。
工作单位 北京畜牧兽医研究所牛遗传育种创新团队
通讯地址北京市海淀区圆明园西路2号牧医所南303办公室
联系电话010-62816065；18519842925
邮箱地址xulingyang@caas.cn
个人简介
徐凌洋，1984年11月生，安徽省寿县人，博士，研究员，博士生导师。2015年经中国农业科学院青年英才计划（A类）引进。2018年入选中国农业科学院农科英才。2006年获西南大学学士学位；2011年获中国农业科学院博士学位；2011年-2012年在北京博奥国家生物芯片研究中心做研究助理。2012-2015年在美国马里兰大学与美国农业部农业研究中心做博士后研究。2015年至今在中国农业科学院北京畜牧兽医研究所工作。现任牛遗传育种创新团队骨干专家，主要从事分子数量遗传学,功能基因组学和群体遗传学研究。
工作经历
2019/01/01-至今：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，研究员
2015/07/01-2019/01/01：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，副研究员
2012/06/01-2015/07/01：美国马里兰大学与美国农业部农业研究中心，博士后
教育经历
2006/09/01-2011/09/01，中国农业科学院研究生院，博士
2002/09/01-2006/07/01，西南大学，学生
获奖荣誉
2023年：徐凌洋（9/15），华西牛新品种培育与联合育种创新应用，北京市人民政府，北京市科学技术奖一等奖。
2017年：徐凌洋（9/15），肉牛全基因组选择分子育种技术体系的建立与应用，中华人民共和国农业部，神农中华农业科技奖一等奖。
社会、学会及学术兼职
中国畜牧兽医学会养牛学分会理事，担任《Animal Research and One Health》,《Biology》、《中国畜禽种业》、《中国牛业科学》等期刊编委，担任国际期刊BMC Genomics; Bioinformatics； BMC Genetics； Scientific reports; Peel J; Frontiers in Genetics; Functional & Integrative Genomics; Genetica; Evolutionary Bioinformatics；G3: Genes | Genomes | Genetics 等审稿人。
研究领域
研究方向包括 1)评估牛群体遗传结构和混合，研究基因组选择与分子进化，综合全基因组选择信号检测与关联分析, 利用基因单倍型网络分析揭示多基因选择的机制。2)搭建多算法基因组拷贝数变异(CNV)分析平台, 研究拷贝数变异的性状关联与群体遗传学特质，整合CNV与SNP的分析揭示复杂性状缺失的遗传力与分子选择进化机制，为更有效的剖析家养动物经济性状和适应性性状提供新的思路。3)利用全基因组关联分析与基因组选择技术解析肉牛复杂经济性状遗传机制，评估与优化基因组选择策略, 为开展动物分子遗传育种和基因组选择育种提供理论基础。
科研项目
1．国家自然科学基金面上项目“肉牛重要经济性状相关拷贝数变异分子机制研究及功能验证”（主持，编号：32272835，2023.1-2026.12, 经费54万）；
2．国家重点研发计划“肉牛产肉性状相关功能变异与瘤胃微生物互作遗传机理研究”（主持，编号：2022YFF1000600，2022.12-2027.12, 经费200万）；
3．国家自然科学基金面上项目“肉牛脂肪酸组分相关多效变异的鉴定及多组学信息验证”（主持，编号：31972554，2020.1-2023.12, 经费59万）；
4．国家自然科学基金青年基金项目“肉用西门塔尔牛经济性状拷贝数变异关联分析与候选区间精细定位”（主持，编号：31702084，2018.1-2021.12, 经费25万）；
5．中国农业科学院院创新人才项目“肉牛基因组选择优化与基因组变异系统研究”（主持，编号：ASTIP-IAS-TS-16, 2016.1-2021.12, 经费160万）；
6．中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目“深度测序解析地方黄牛适应性状分子遗传进化机制”（主持，编号：2016ywf-yb-6, 2016.1-2018.12, 经费30万）。
发表论文
以第一或通讯作者在BMC Biology、Communications Biology、Journal of Animal Science and Biotechnology及BMC Genomics等行业知名学术期刊发表高水平学术论文40余篇。部分代表性论文如下
Zhu B, Wang T, Niu Q, Wang Z, Hay EH, Xu L, Chen Y, Zhang L, Gao X, Gao H, Cao Y, Zhao Y, Xu L*, Li J*. Multiple strategies association revealed functional candidate FASN gene for fatty acid composition in cattle. Commun Biol. 2025 Feb 10;8(1):208. doi: 10.1038/s42003-025-07604-z.
Zhao Z, Niu Q, Wu J, Wu T, Xie X, Wang Z, Zhang L, Gao H, Gao X, Xu L*, Zhu B*, Li J*. Integrating multi-layered biological priors to improve genomic prediction accuracy in beef cattle. Biol Direct. 2024 Dec 31;19(1):147. doi: 10.1186/s13062-024-00574-y.
Zhang T, Wang T, Niu Q, Xu L, Chen Y, Gao X, Gao H, Zhang L, Liu GE, Li J, Xu L*. Transcriptional atlas analysis from multiple tissues reveals the expression specificity patterns in beef cattle. BMC Biol. 2022 Mar 29;20(1):79.
Wang T, Niu Q, Zhang T, Zheng X, Li H, Gao X, Chen Y, Gao H, Zhang L, Liu GE, Li J, Xu L*. Cis-eQTL Analysis and Functional Validation of Candidate Genes for Carcass Yield Traits in Beef Cattle. Int J Mol Sci. 2022 Dec 1;23(23):15055.
Zhang T, Wang T, Niu Q, Zheng X, Li H, Gao X, Chen Y, Gao H, Zhang L, Liu GE, Li J, Xu L*. Comparative transcriptomic analysis reveals region-specific expression patterns in different beef cuts. BMC Genomics. 2022 May 20;23(1):387.
Zhang T, Niu Q, Wang T, Zheng X, Li H, Gao X, Chen Y, Gao H, Zhang L, Liu GE, Li J, Xu L*. Comparative Transcriptomic Analysis Reveals Diverse Expression Pattern Underlying Fatty Acid Composition among Different Beef Cuts. Foods. 2022 Jan 4;11(1):117.
Zhao G, Liu Y, Niu Q, Zheng X, Zhang T, Wang Z, Xu L, Zhu B, Gao X, Zhang L, Gao H, Li J, Xu L*. Runs of homozygosity analysis reveals consensus homozygous regions affecting production traits in Chinese Simmental beef cattle. BMC Genomics. 2021 Sep 21;22(1):678.
Niu Q, Zhang T, Xu L, Wang T, Wang Z, Zhu B, Zhang L, Gao H, Song J, Li J, Xu L*. Integration of selection signatures and multi-trait GWAS reveals polygenic genetic architecture of carcass traits in beef cattle. Genomics. 2021 Sep;113(5):3325-3336.
Yang L, Niu Q, Zhang T, Zhao G, Zhu B, Chen Y, Zhang L, Gao X, Gao H, Liu GE, Li J, Xu L*. Genomic sequencing analysis reveals copy number variations and their associations with economically important traits in beef cattle. Genomics. 2021 Jan;113(1 Pt 2):812-820.
Xu L*, Zhao G, Yang L, Zhu B, Chen Y, Zhang L, Gao X, Gao H, Liu GE, Li J. Genomic Patterns of Homozygosity in Chinese Local Cattle. Sci Rep. 2019 Nov18;9(1):16977.
Xu L, Wang Z, Zhu B, Liu Y, Li H, Bordbar F, Chen Y, Zhang L, Gao X, Gao H, Zhang S, Xu L*, Li J*. Theoretical Evaluation of Multi-Breed Genomic Prediction in Chinese Indigenous Cattle. Animals (Basel). 2019 Oct 11;9(10).
Xu L*, Yang L, Zhu B, Zhang W, Wang Z, Chen Y, Zhang L, Gao X, Gao H, Liu GE, Li J*. Genome-wide scan reveals genetic divergence and diverse adaptive selection in Chinese local cattle. BMC Genomics. 2019 Jun 14;20(1):494.
Wang Z, Zhu B, Niu H, Zhang W, Xu L, Xu L, Chen Y, Zhang L, Gao X, Gao H, Zhang S, Xu L*, Li J*. Genome wide association study identifies SNPs associated with fatty acid composition in Chinese Wagyu cattle. J Anim Sci Biotechnol. 2019 Mar 4;10:27.
Xu L*, Yang L, Wang L, Zhu B, Chen Y, Gao H, Gao X, Zhang L, Liu GE, Li J*. Probe-based association analysis identifies several deletions associated with average daily gain in beef cattle. BMC Genomics. 2019 Jan 10;20(1):31.
科研创新
（1）肉用西门塔尔牛19号染色体上与脂肪酸C14：0含量相关的SNP位点及应用.发明专利. 2020
（2）一种精细定位性状关联基因组纯合片段的评估方法.发明专利. 2022
（3）大动物静脉专用采血针.实用新型专利. 2020
（4）一种牛体刷.ZL201920732961.X.实用新型专利. 2020
教学活动
主要从事《高级动物育种学》、《专业英语》等教学工作。
指导学生
先后指导或协助指导研究生10余人（含博士后、博士生、硕士生）。
